Pada masa penjajahan Belanda, ada pasangan suami istri Belanda-Jawa yang bernama Van Rodjnik dan Mustika. Mereka mempunyai seorang putri kecil, bernama Helenina. Biasa dipanggil Nina. Sedari kecil, Nina mengalami kesulitan tidur. Ibunya, Mustika, pun membuatkan senandung untuk Nina agar bisa tidur. Mustika pun bersenandung setiap malam agar Nina tertidur. Ayahnya, Van Rodjnik memberikan lirik dalam senandung itu. Nina bobo, oh Nina bobo, kalau tidak bobo digigit nyamuk. Dan lirik itulah yang kita nyanyikan sampai sekarang. Mustika pun setiap malam menyanyikan lagu tersebut sampai Nina tertidur.
Hingga pada suatu hari, Nina menderita sakit parah dan akhirnya meninggal dunia di usia 6 tahun. Kepergian Nina menciptakan kesedihan mendalam bagi Van Rodjnik dan Mustika. Putri satu-satunya harus pergi di usia semuda itu. Mustika terpukul dan tidak terima dengan kenyataan ini.
Van Rodjnik melihat keanehan pada istrinya, Mustika. Ia menyanyikan lagu Nina Bobo di kamar mandi karena mendengar suara Nina yang menangis minta dinyanyikan lagu tersebut. Akhirnya Mustika menyanyikan Nina Bobo setiap hari hingga akhirnya ia juga ikut meninggal dunia.
Tinggallah Van Rodjnik sendiri…
Setelah istrinya meninggal, giliran Van Rodjnik yang dihantui suara tangis anaknya. Pada suatu malam ada tangan anak kecil yang menarik-nariknya minta dinyanyikan lagu. Ia pun menyanyikan lagu Nina Bobo karena terus diganggu setiap hari. Van Rodjnik menyanyikan Nina Bobo berulang-ulang hingga akhirnya ia pun ikut meninggal. Sebuah akhir yang tragis dari sebuah keluarga kecil ini.
